En el curro yo tenía montado todo un sistema de copias de seguridad de los servidores con ssh y funcionaba muy bien. Es una herramienta fantástica.
Por cierto te recomiendo instalar sshfs, que te monta la carpeta de la máquina remota que quieras como una carpeta más de tu disco local. Con eso se acabaron los problemas.

Saludos