Hola
Creo que lo que está pasando es que al tener que suministrar una contraseña justo después de ejecutar el comando, el atajo de teclado, aunque lo intenta, no responde y se queda esperando que se introduzca esa contraseña. Como no se muestra una consola o algo donde introducirla, el comando falla miserablemente.
Creo que lo que necesitas es instruir al sistema para que no pida la contraseña al ejecutar ese comando concreto, lo cual no parece peligroso en absoluto en este caso. Este enlace te servirá también en Debian, supongo, ya que es para Ubuntu pero como sabes ésta última es un derivado de la primera.
https://ubunlog.com/archivo-sudoers-sin-..._en_Ubuntu
Para averiguar la ruta del programa hibernate, ejecuta
which hibernate y úsala dentro del fichero de configuración de sudoers y también para el comando de atajo de teclado. Y no olvides contarnos los resultados!