Lo de las variables no lo he probado porque siempre me ha bastado el entorno por defecto del sistema.
Lo de los argumentos es sencillo:
1.- En la pantalla que aparece al pulsar el menú Depuración->Configuración, añades un Argumento:
2.- Luego seleccionas que el programa se ejecute con argumentos en el desplegable que aparece en el botón de la flechita:
Y ya está. Ejecutas tu programa y dispones del argumento tecleado. Da igual si es un programa de consola o gráfico.
Saludos