Buenas!.

¿ Existe alguna forma en Linux de que el usuario no vea ciertos menús del escritorio, de que no pueda usar ciertas aplicaciones ( ok, esto es administrador ) ?.

Cuando el usuario ve un menú de aplicaciones, opciones, encuentra de todo. Y hay cosas que a lo mejor pueden ser no adecuadas para alguien que comienza
con Linux. Supongamos que tiene acceso a un número de aplicaciones determinadas pero no al resto.

Por decir algo. Libreoffice, navegador y otras más. Digamos que las aplicaciones que realmente va utilizar.
O crear un usuario que tiene un uso del sistema "limitado".

Imaginar que es un niño.

Saludos

Y hay cosas que a lo mejor pueden ser no adecuadas para alguien que comienza

Una vez leí una firma de un forero que me agradó: "En el mundo, sólo hay dos tipos de personas: Las que saben binario y las que no".

Creo que viene al caso, porque efectivamente siempre habrá personas que les interesen "las tripas" del Software y del Hardware, mientras que otra inmensa cantidad de gente usan la PC o Laptop sin interesarse en lo más mínimo en cuestiones técnicas acerca de su funcionamiento.

Éstas últimas han resultado ser la fuente de ingresos para quienes se dedican a reparar Software y Hardware y les agradecemos mucho. Pero cuando trabajas, como yo, en un organismo gubernamental, en donde das servicio técnico a las PC's y Laptops de 1,500 usuarios y todo por el mismo sueldo, es necesario "amarrarles" las manos a muchos de esos usuarios.

Constantemente nos llaman a servicio, porque "su computador dejó de funcionar". Nosotros, un grupo de técnicos especializados en el tema, acudimos a brindar el servicio y por respeto (porque a veces son altos funcionarios) no les preguntamos: "que cosa le hiciste?".

Afortunadamente, por los síntomas sabemos casi de inmediato la causa: El usuario, teniendo bastantes horas de ocio, le da por "tentalear" por aquí por allá carpetas y archivos, hasta que en una de esas "comete" un error que da al traste con su sistema operativo.

Incluso hubo una persona, que navegando en la red propia de la organización, se asustó al ver "su propia computadora en la red, compartiendo todos sus archivos" y se puso a borrarlos, "para que ya no se pudieran ver en dicha red". Terminó casi con su disco duro vacío, respecto a sus archivos de trabajo. Poco pudimos hacer para recuperar ese disco.

Pues si. Vale la pena poner a usuarios en un modo donde no puedan fastidiarse a sí mismos.

"En el mundo, sólo hay dos tipos de personas: Las que saben binario y las que no".

La frase en realidad es "En el mundo, sólo hay 10 tipos de personas: Las que saben binario y las que no". 

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¿ Existe alguna forma en Linux de que el usuario no vea ciertos menús del escritorio, de que no pueda usar ciertas aplicaciones ( ok, esto es administrador ) ?.

Tu pregunta es muy general, no especificas ni la distribución ni el escritorio, así que a menos que expliques mejor el tema no hay forma de responderte algo que te sirva.

Saludos.

Afortunadamente, por los síntomas sabemos casi de inmediato la causa: El usuario, teniendo bastantes horas de ocio, le da por "tentalear" por aquí por allá carpetas y archivos, hasta que en una de esas "comete" un error que da al traste con su sistema operativo.

No siempre es así. Se puede estropear y a lo mejor es el propio sistema que no es "tan bueno" como debería ser.
Por otra parte como desarrolladores de todos los niveles, el software tiene sus errores y no hay otra forma de verlo que usándolo.
Sin ir mas lejos, alguna actualización puede fastidiar algo. Apunto esto para más tarde.
 

Tu pregunta es muy general, no especificas ni la distribución ni el escritorio, así que a menos que expliques mejor el tema no hay forma de responderte algo que te sirva.

Cierto. Si especifico una distro, nos centraríamos en ella. Debería ser algo más general, algo que se pueda hacer en todas. O por lo menos
donde deberíamos tocar. Si nuestro sistema es capaz de hacerlo. Si, sé que hay distros que pueden "ocultar" ciertos menús.

Es sencillo, lo único que quieres es que el usuario pueda usar las aplicaciones pero limitar el uso de aplicaciones que puedan ocasionar
un problema en manos que no tienen experiencia.

Ejemplo. No quieres que el usuario tenga acceso a los archivos del sistema. No puede subir de directorios.
No puede ver aplicaciones de administración por decir algo. Claro que tu puedas ocultar no quiere decir que
no lo pueda llegar a usar.

Si hablamos de Linux Mint 19.3 podemos ver en su editor de menús esto:



Pero eso no quiere decir que el usuario no tenga acceso a las aplicaciones "de alguna forma".
Si limitas el usuario solo al escritorio y nada más que el escritorio es otra forma de cortar el acceso al usuario.

No sé como lo harán en los centros de enseñanza pero desde luego no debe ser fácil.

Saludos