Hola tincho
Después de instalar gnome-builder y glade, he podido empezar a funcionar con GJS, pero a medias.
La aplicación de prueba auto generada no corre en builder por un error que no da pistas de ningún tipo y no soy capaz de solventar (error que puede verse en la captura de pantalla en el terminal).
Por otro lado, el formulario auto-generado sí que puedo visualizarlo en glade y editarlo a mi gusto, pero no sirve de nada si la aplicación no funciona...
No sé si con esto te aclaro alguna duda, estoy usando Linux Mint 20.3 con Cinnamon, la versión de builder es la 3.36 y la de glade 3.22.2.
La instalación de gnome-builder y glade no me ha dado ningún problema al ejecutarla desde la consola con 'apt install'.
Si estás en otro sistema no basado en Debian, puede que las versiones tengan algún bug.